MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Actinobacillus suis H91-0380 chromosome

Total Repeats: 48934

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018690	TTG	2	6	176	181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407691595
2	NC_018690	TCG	2	6	215	220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407691595
3	NC_018690	CGG	2	6	284	289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407691595
4	NC_018690	AGA	2	6	333	338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407691595
5	NC_018690	CAA	2	6	442	447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407691595
6	NC_018690	CGG	2	6	495	500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407691595
7	NC_018690	TTA	2	6	523	528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407691595
8	NC_018690	CGGT	2	8	533	540	0 %	25 %	50 %	25 %	407691595
9	NC_018690	TGA	2	6	677	682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407691595
10	NC_018690	TAA	2	6	705	710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407691595
11	NC_018690	AAG	2	6	722	727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407691595
12	NC_018690	ATT	2	6	750	755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407691595
13	NC_018690	TAA	2	6	762	767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407691595
14	NC_018690	ATT	2	6	772	777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407691595
15	NC_018690	GAA	2	6	817	822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407691595
16	NC_018690	G	6	6	845	850	0 %	0 %	100 %	0 %	407691595
17	NC_018690	ACC	2	6	867	872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407691595
18	NC_018690	TGA	2	6	899	904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407691595
19	NC_018690	A	6	6	904	909	100 %	0 %	0 %	0 %	407691595
20	NC_018690	GAA	2	6	913	918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407691595
21	NC_018690	GAA	2	6	937	942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407691595
22	NC_018690	CTT	2	6	1085	1090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407691595
23	NC_018690	A	6	6	1121	1126	100 %	0 %	0 %	0 %	407691595
24	NC_018690	ACA	2	6	1142	1147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407691595
25	NC_018690	CTCGTC	2	12	1193	1204	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	407691595
26	NC_018690	AAG	2	6	1346	1351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407691595
27	NC_018690	ATT	2	6	1397	1402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018690	ACA	2	6	1444	1449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407691596
29	NC_018690	AGC	2	6	1466	1471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407691596
30	NC_018690	TAA	2	6	1492	1497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407691596
31	NC_018690	A	6	6	1622	1627	100 %	0 %	0 %	0 %	407691596
32	NC_018690	AGC	2	6	1661	1666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407691596
33	NC_018690	GAA	2	6	1682	1687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407691596
34	NC_018690	GTTA	2	8	1696	1703	25 %	50 %	25 %	0 %	407691596
35	NC_018690	TGAT	2	8	1818	1825	25 %	50 %	25 %	0 %	407691596
36	NC_018690	ACGG	2	8	1919	1926	25 %	0 %	50 %	25 %	407691596
37	NC_018690	TTA	2	6	1967	1972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407691596
38	NC_018690	AGTG	2	8	2029	2036	25 %	25 %	50 %	0 %	407691596
39	NC_018690	GGTGT	2	10	2090	2099	0 %	40 %	60 %	0 %	407691596
40	NC_018690	TGCG	2	8	2208	2215	0 %	25 %	50 %	25 %	407691596
41	NC_018690	GCGT	2	8	2244	2251	0 %	25 %	50 %	25 %	407691596
42	NC_018690	AAG	3	9	2301	2309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407691596
43	NC_018690	TGG	2	6	2424	2429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407691596
44	NC_018690	GCT	2	6	2442	2447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407691596
45	NC_018690	TTA	2	6	2484	2489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407691596
46	NC_018690	ATT	2	6	2526	2531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018690	ATC	2	6	2584	2589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407691597
48	NC_018690	AAT	2	6	2590	2595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407691597
49	NC_018690	TC	3	6	2611	2616	0 %	50 %	0 %	50 %	407691597
50	NC_018690	AATTTT	2	12	2635	2646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407691597
51	NC_018690	CTG	2	6	2680	2685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407691597
52	NC_018690	T	6	6	2693	2698	0 %	100 %	0 %	0 %	407691597
53	NC_018690	CGGT	2	8	2709	2716	0 %	25 %	50 %	25 %	407691597
54	NC_018690	TGA	2	6	2787	2792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407691597
55	NC_018690	GGTC	2	8	2807	2814	0 %	25 %	50 %	25 %	407691597
56	NC_018690	A	6	6	2824	2829	100 %	0 %	0 %	0 %	407691597
57	NC_018690	TAA	2	6	2871	2876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407691597
58	NC_018690	TTA	2	6	2935	2940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407691597
59	NC_018690	TGG	2	6	2943	2948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407691597
60	NC_018690	CCA	2	6	2988	2993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407691597
61	NC_018690	TGCG	2	8	3137	3144	0 %	25 %	50 %	25 %	407691597
62	NC_018690	TG	3	6	3398	3403	0 %	50 %	50 %	0 %	407691597
63	NC_018690	TGAT	2	8	3464	3471	25 %	50 %	25 %	0 %	407691597
64	NC_018690	CAA	2	6	3625	3630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407691597
65	NC_018690	ATTTAA	2	12	3685	3696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018690	ACC	3	9	3745	3753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407691598
67	NC_018690	TGC	2	6	3760	3765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407691598
68	NC_018690	AATG	2	8	3806	3813	50 %	25 %	25 %	0 %	407691598
69	NC_018690	GTG	2	6	3843	3848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407691598
70	NC_018690	GTT	2	6	3859	3864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407691598
71	NC_018690	GTT	2	6	3939	3944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407691598
72	NC_018690	CCG	2	6	3968	3973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407691598
73	NC_018690	CTA	2	6	3987	3992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407691598
74	NC_018690	TCTTTT	2	12	4001	4012	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	407691598
75	NC_018690	TAC	2	6	4168	4173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407691598
76	NC_018690	TGG	2	6	4205	4210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407691598
77	NC_018690	GCA	3	9	4220	4228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407691598
78	NC_018690	AAT	2	6	4244	4249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407691598
79	NC_018690	AG	3	6	4255	4260	50 %	0 %	50 %	0 %	407691598
80	NC_018690	TTTTAG	2	12	4292	4303	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018690	AT	3	6	4347	4352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018690	AAAT	2	8	4419	4426	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018690	T	7	7	4564	4570	0 %	100 %	0 %	0 %	407691599
84	NC_018690	GAA	2	6	4650	4655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407691599
85	NC_018690	TGC	2	6	4727	4732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407691599
86	NC_018690	TTA	2	6	4822	4827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407691599
87	NC_018690	TTG	2	6	4858	4863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407691599
88	NC_018690	CGG	2	6	4901	4906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407691599
89	NC_018690	TAG	2	6	4924	4929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407691599
90	NC_018690	A	6	6	4976	4981	100 %	0 %	0 %	0 %	407691599
91	NC_018690	AGA	2	6	5015	5020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407691599
92	NC_018690	TCA	2	6	5052	5057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407691599
93	NC_018690	ATT	2	6	5165	5170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407691599
94	NC_018690	AGA	2	6	5189	5194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407691599
95	NC_018690	TG	3	6	5265	5270	0 %	50 %	50 %	0 %	407691599
96	NC_018690	A	6	6	5319	5324	100 %	0 %	0 %	0 %	407691599
97	NC_018690	ATT	2	6	5352	5357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407691599
98	NC_018690	GCG	2	6	5358	5363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407691599
99	NC_018690	ACT	2	6	5403	5408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407691599
100	NC_018690	ATT	2	6	5522	5527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407691599
101	NC_018690	CGT	2	6	5550	5555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407691599
102	NC_018690	AAT	2	6	5575	5580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407691599
103	NC_018690	ATTA	2	8	5585	5592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018690	A	7	7	5619	5625	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018690	TTAT	2	8	5643	5650	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018690	GAT	2	6	5694	5699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018690	CAA	2	6	5729	5734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407691600
108	NC_018690	TGT	2	6	5736	5741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407691600
109	NC_018690	ATTT	2	8	5753	5760	25 %	75 %	0 %	0 %	407691600
110	NC_018690	AGT	2	6	5855	5860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407691600
111	NC_018690	CCA	2	6	5870	5875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407691600
112	NC_018690	TTTC	2	8	5887	5894	0 %	75 %	0 %	25 %	407691600
113	NC_018690	CATA	2	8	5942	5949	50 %	25 %	0 %	25 %	407691600
114	NC_018690	TCA	2	6	5965	5970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407691600
115	NC_018690	GAT	2	6	5978	5983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407691600
116	NC_018690	CTT	2	6	5999	6004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407691600
117	NC_018690	ACG	2	6	6048	6053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407691600
118	NC_018690	ACCG	2	8	6099	6106	25 %	0 %	25 %	50 %	407691600
119	NC_018690	TCA	2	6	6196	6201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407691600
120	NC_018690	TTATAA	2	12	6205	6216	50 %	50 %	0 %	0 %	407691600
121	NC_018690	ACTGA	2	10	6338	6347	40 %	20 %	20 %	20 %	407691600
122	NC_018690	ACG	2	6	6348	6353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407691600
123	NC_018690	TAA	2	6	6366	6371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407691600
124	NC_018690	GTTT	2	8	6406	6413	0 %	75 %	25 %	0 %	407691600
125	NC_018690	TGA	2	6	6490	6495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407691600
126	NC_018690	CAC	2	6	6548	6553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407691600
127	NC_018690	GTT	2	6	6599	6604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407691600
128	NC_018690	TTTA	2	8	6648	6655	25 %	75 %	0 %	0 %	407691600
129	NC_018690	AAT	2	6	6769	6774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407691600
130	NC_018690	T	7	7	6830	6836	0 %	100 %	0 %	0 %	407691600
131	NC_018690	TCAA	2	8	6895	6902	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_018690	TAA	2	6	6947	6952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018690	AAT	2	6	6966	6971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018690	ATG	2	6	6988	6993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407691601
135	NC_018690	AAG	2	6	6998	7003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407691601
136	NC_018690	CGT	2	6	7219	7224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407691601
137	NC_018690	TTTAA	2	10	7291	7300	40 %	60 %	0 %	0 %	407691601
138	NC_018690	GAA	2	6	7306	7311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407691601
139	NC_018690	GTTA	2	8	7680	7687	25 %	50 %	25 %	0 %	407691601
140	NC_018690	GAT	2	6	7779	7784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407691601
141	NC_018690	CTTG	2	8	7800	7807	0 %	50 %	25 %	25 %	407691601
142	NC_018690	GCG	2	6	7819	7824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407691601
143	NC_018690	TGT	2	6	7835	7840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407691601
144	NC_018690	CTGG	2	8	7887	7894	0 %	25 %	50 %	25 %	407691601
145	NC_018690	AT	3	6	7917	7922	50 %	50 %	0 %	0 %	407691601
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147	NC_018690	ATT	2	6	8015	8020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407691601
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153	NC_018690	AATT	2	8	8164	8171	50 %	50 %	0 %	0 %	407691601
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164	NC_018690	AAG	2	6	8470	8475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407691602
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172	NC_018690	TGGTG	2	10	8804	8813	0 %	40 %	60 %	0 %	407691602
173	NC_018690	A	6	6	8844	8849	100 %	0 %	0 %	0 %	407691602
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194	NC_018690	TAA	2	6	9749	9754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407691603
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229	NC_018690	AT	3	6	11615	11620	50 %	50 %	0 %	0 %	407691605
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239	NC_018690	CAT	2	6	11962	11967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407691605
240	NC_018690	ATC	2	6	12034	12039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407691605
241	NC_018690	ACCTTT	2	12	12175	12186	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	407691605
242	NC_018690	TTC	2	6	12268	12273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407691605
243	NC_018690	T	7	7	12333	12339	0 %	100 %	0 %	0 %	407691605
244	NC_018690	GAG	2	6	12373	12378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
245	NC_018690	CAT	2	6	12480	12485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407691606
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247	NC_018690	T	6	6	12588	12593	0 %	100 %	0 %	0 %	407691606
248	NC_018690	TAA	2	6	12690	12695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407691606
249	NC_018690	ACT	2	6	12875	12880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407691606
250	NC_018690	CTG	2	6	12903	12908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407691606
251	NC_018690	TAA	2	6	12951	12956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407691606
252	NC_018690	TTG	2	6	13015	13020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407691606
253	NC_018690	CATTG	2	10	13021	13030	20 %	40 %	20 %	20 %	407691606
254	NC_018690	CA	3	6	13157	13162	50 %	0 %	0 %	50 %	407691606
255	NC_018690	GAT	2	6	13178	13183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407691606
256	NC_018690	TCT	2	6	13223	13228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407691606
257	NC_018690	CAA	2	6	13299	13304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407691606
258	NC_018690	T	6	6	13388	13393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
259	NC_018690	TTAT	2	8	13398	13405	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
260	NC_018690	AC	3	6	13422	13427	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
261	NC_018690	GCGT	2	8	13429	13436	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
262	NC_018690	AAT	2	6	13445	13450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
263	NC_018690	AAT	2	6	13464	13469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407691607
264	NC_018690	GAC	2	6	13494	13499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407691607
265	NC_018690	ATTT	2	8	13515	13522	25 %	75 %	0 %	0 %	407691607
266	NC_018690	CCG	2	6	13607	13612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407691607
267	NC_018690	CAT	2	6	13644	13649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407691607
268	NC_018690	GCG	2	6	13658	13663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407691607
269	NC_018690	AGC	2	6	13719	13724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407691607
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401	NC_018690	CAA	2	6	19252	19257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407691614
402	NC_018690	ATT	2	6	19267	19272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407691614
403	NC_018690	TTA	2	6	19288	19293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407691614
404	NC_018690	TTTA	2	8	19354	19361	25 %	75 %	0 %	0 %	407691614
405	NC_018690	TTG	3	9	19362	19370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407691614
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